Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam208bQ5DTT3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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