Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spire1Q52KF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms