Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Herc2Q4U2R1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Herc2Q4U2R1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Herc2Q4U2R1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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