Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem40Q4FJU9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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