Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brinp3Q499E0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brinp3Q499E0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms