Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2Q8

N4bp2l1, NEDD4-binding protein 2-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2l1Q3V2Q8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp2l1Q3V2Q8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms