Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc185Q3V118 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms