Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms