Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms