Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms