Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaaf3Q3UYV8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms