Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms