Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms