Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc38a11Q3USY0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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