Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms