Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms