Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Tmem253Q3UNB8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms