Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms