Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms