Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms