Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6cQ3UHC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms