Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms