Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms