Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms