Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms