Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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