Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kdm4dQ3U2K5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms