Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf149Q3U2C5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf149Q3U2C5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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