Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TraddQ3U0V2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TraddQ3U0V2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms