Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc9Q3U0M1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms