Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Smarca4Q3TKT4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms