Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc127Q3TC33 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc127Q3TC33 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms