Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem104Q3TB48 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms