Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms