Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riiad1Q3KNY5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms