Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3KNL4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms