Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ush2AQ2QI47 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms