Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms