Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms