Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms