Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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