Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam171bQ14CH0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam171bQ14CH0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam171bQ14CH0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam171bQ14CH0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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