Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms