Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Perm1Q149B8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms