Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd2Q0VET5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd2Q0VET5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms