Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms