Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms