Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms