Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col9a2Q07643 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col9a2Q07643 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col9a2Q07643 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col9a2Q07643 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col9a2Q07643 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms