Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf3Q07104 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms